Die Musik-Akademie der Stadt Basel vereinigt unter einem Dach vier Institute mit folgenden Zielsetzungen:
An der Allgemeinen Musikschule erteilen qualifizierte Lehrkräfte Musikunterricht für Laien (Kinder und Erwachsene). Geeignete Schüler/innen werden auch auf eine Berufsmusiker/innen-Ausbildung vorbereitet.
Die Hochschule für Musik vermittelt die berufliche Ausbildung in allen praktischen und theoretischen Zweigen der sogenannten 'Ernsten' Musik bis zur Gegenwart und des Jazz. Die Musikhochschule gliedert sich in Ausbildungsklassen, Konzertklassen, Orchesterschule, Elektronisches Studio und Studio für Musik und Theater.
Die Schola Cantorum Basiliensis ist ein Zentrum für Alte Musik mit Unterricht an Laien und Berufsstudierende unter dem Aspekt einer lebendigen Wechselwirkung zwischen Wissenschaft und Praxis. Die Schola Cantorum Basiliensis gliedert sich in die Hochschule für Alte Musik, die Allgemeine Schule, die Forschungsabteilung und den Konzertbereich.
Die Musikalischen Grundkurse sind Teil des Bildungsangebotes der Primarschulen des Kantons Basel-Stadt. Sie werden von der Musik-Akademie im Auftrag des Erziehungsdepartements betreut.
Nebst den vier Instituten existiert an der Musik-Akademie das Studio für aussereuropäische Musik.
